第一阶段：申请受理阶段
按照《通用航空经营许可管理规定》，申请人通过"通用航空管理系统"在线提交经营许可申请材料。
第二阶段：审查决定阶段
民航地区管理局通过"通用航空管理系统"对申请材料进行审核，并出具受理意见。自受理之日起在20日内作出是否准予许可的决定。20日内不能做出决定的，经民航地区管理局负责人批准，可以延长10日。
通用航空企业经营许可办理步骤
第三阶段：结果通知阶段
民航地区管理局在做出决定之日起10个工作日内向申请人颁发经营许可证，并将许可决定通过"通用航空管理系统"予以公布。如不予许可，将书面通知申请人不予许可的决定，并说明理由，同时告知申请人享有依法申请行政复议或者提起行政诉讼的权利。