CE认证涉及20多个指令。常见的是LVD低压指令、EMC指令、toy指令、MD机械指令、MDD医疗器械指令、PED压力设备指令、PPE个人防护指令、cpd施工指令、reach化工产品指令、ATEX防爆指令，这是认证市场中常见的指令，也是目前证书数量多的指令。
不同的认证指令有不同的适用标准。同时，对于不同性质的产品，欧盟CE认证体系也规定了相应的认证要求，如ped压力设备指令、PPE个人防护指令、MDD医疗器械指令。这些指令基本上是必须由第三方欧盟授权认证机构参与的认证指令，也就是说，这些指令必须要求欧盟公告编号机构颁发CE证书，它不是可以颁发证书的临时机构，否则它不能被欧盟海关认可。