企业自己做 ISO 9001 认证可能会遇到以下困难：
一、标准理解方面
解读不准确：
ISO 9001 标准具有一定的专业性和复杂性，企业人员可能难以准确理解标准中的各项要求。例如，对于 “持续改进”“基于风险的思维” 等概念的理解可能存在偏差，导致在建立质量管理体系时方向错误。
对于标准中不同条款之间的关系把握不准，可能会孤立地看待各个要求，无法形成一个有机的整体体系。
应用不恰当：
在实际操作中，不知道如何将标准要求与企业的具体业务流程相结合。例如，在确定质量管理体系的范围时，可能会出现范围过窄或过宽的情况，影响体系的有效性。
对于标准中推荐的方法和工具，如过程方法、PDCA 循环等，不知道如何正确应用到企业的管理中。
二、体系建立方面
缺乏系统性规划：
企业自行建立体系时，可能没有一个全面的规划，导致体系建立过程混乱。例如，在确定质量方针和目标时，没有充分考虑企业的战略方向和实际情况，使得质量目标缺乏可操作性。
各个部门之间的协作可能不顺畅，出现职责不清、推诿扯皮的情况，影响体系的建立进度和质量。
资源不足：
建立质量管理体系需要投入一定的人力、物力和财力资源。企业可能由于资源有限，无法配备足够的专业人员来负责体系建立工作，或者无法提供必要的培训和技术支持。
在文件编制、内部审核、管理评审等环节，可能因为资源不足而无法充分开展，影响体系的完善程度。
三、实施与运行方面
执行力不够：
即使建立了质量管理体系文件，但在实际实施过程中，可能由于员工意识不强、培训不到位等原因，导致执行不力。例如，员工不按照规定的流程进行操作，或者对质量记录的填写不认真。
管理层的支持力度不够也会影响体系的执行效果。如果管理层没有以身作则，带头遵守体系要求，员工就会缺乏积极性和主动性。
问题发现与解决不及时：
在体系运行过程中，可能会出现各种问题，如质量目标未达成、过程失控等。企业如果没有有效的监测和反馈机制，就难以及时发现这些问题。
即使发现了问题，由于缺乏专业的分析和解决问题的能力，可能无法采取有效的纠正措施和预防措施，导致问题重复出现。
四、审核与认证方面
内部审核不专业：
企业自己进行内部审核时，审核人员可能由于缺乏专业的审核知识和经验，无法发现体系中的深层次问题。例如，审核过程中可能存在走过场、形式主义的情况，审核结果不客观、不准确。
内部审核的范围和深度可能不够，无法覆盖质量管理体系的所有方面，影响审核的有效性。
认证准备不充分：
对于认证机构的审核流程和要求不熟悉，可能在认证准备过程中出现遗漏或错误。例如，在提交认证申请材料时，可能因为材料不完整或不符合要求而被退回。
在认证审核过程中，可能由于紧张或应对不当，导致审核不通过。例如，对审核员提出的问题无法给出合理的解释或提供有效的证据。