医院污水处理后排放去向分为排入自然水体和通过市政下水道排入城市污水处理厂两类。医院污水处理所用工艺必须确保处理出水达标，主要采用的三种工艺有：加强处理效果的一级处理、二级处理和简易生化处理。
工艺选择原则为：传染病医院必须采用二级处理，并需进行预消毒处理。处理出水排入自然水体的县及县以上医院必须采用二级处理。处理出水排入城市下水道(下游设有二级污水处理厂)的综合医院推荐采用二级处理，对采用一级处理工艺的必须加强处理效果。
对于经济不发达地区的小型综合医院，条件不具备时可采用简易生化处理作为过渡处理措施，之后逐步实现二级处理或加强处理效果的一级处理。对于处理出水终进入二级处理城市污水处理厂的综合医院，应加强其处理效果，提高SS的去除率，减少消毒剂用量。
疾控中心污水处理设备
（技术说明）加强一级处理效果宜通过两种途径实现：对现有一级处理工艺进行改造以加强去除效果和采用一级强化处理技术。医院污水处理的目的是通过采用二氧化氯发生器现场制备二氧化氯溶液去除水中物理的、化学的和生物学的各种水污染物，使水质得到净化，达到国家或地方水污染物质排放标准，保护水资源和人体健康。
医院排放污水的主要部门和设施有：诊疗室、化验室、病房、洗衣房、X光照像洗印、动物房、同位素治疗诊断、手术室等排水；医院行政管理和医务人员排放的生活污水等。病原性微生物及控制指标：粪大肠菌群数和大肠菌群数；传染性细菌和病毒。有毒、有害物质：pH值；SS；COD和BOD。放射性同位素。医院污水排放量不大，属小型污水处理。
常用的处理方法按其作用原理可分为物理法、化学法和生物法。按处理程度可分为一级处理、二级处理和三级处理等。医院污水处理所用工艺必须确保处理出水达标，特别是SARS病人污染过的污水达到国家规定的标准排放。
主要采用三种工艺：一级处理、加强处理效果的一级处理和二级处理。对含病原体污水大部分医院采用的是一级处理和氯化消毒技术，少数医院采用二级处理和氯化消毒技术。
设备简介
处理设备由废水分类收集单元、废水调节单元、废水深度处理单元、沉降分离单元、物理处理单元、生物处理单元、废水综合净化单元等构成。通过化学预处理、化学深度处理、斜管沉淀、多程消du灭菌、过滤沉淀分离、高低电位差微电解技术、电化学氧化还原技术、两级有机生物膜净化、有机废水新型填充床光波cui化fan应技术、更新液选择性传质及菌丝体表面分子印迹技术等处理工艺对实验室内产生的有机、无机、生物废水进行综合处理，可有效去除废水中的COD、BOD、SS、色度和重金属离子等，针对不同实验废水的组成成分，采用不同的处理技术及控制系统进行废水处理。产品具有技术先进、自动化程度高、无需专人职守、处理效果好、占地面积小、操作管理方便等优点
应用范围
废水处理设备广泛应用于中、高等院校、科研院所、医疗机构、生物制药、疾控中心、环监、产品质检、检验检疫、药品检验、血站、畜牧、医院、石油化工、企业等实验室、化验室废水处理，经过处理后废水达到废水综合排放标准【GB】中的一级、二级、三级标准，处理后的污水可排入市政污水管网，也可以通过再处理工艺把处理后的废水进行再利用。
设备应用领域
中、高等院校：生命科学院、化工学院、材料学院、环境学院、食品学院、医学院、农学院等实验室所产生的废水；
科研院所：研究院、研究所、测试中心、检验中心等在研究过程中所产生的实验室废水；
疾控中心：理化检验、微生物、PCR、P2、P3、P4等实验室所产生的废水；
畜牧兽医：动物防疫、病原微生物等实验室所产生的废水；
药品检验：化学室、药品室等实验室所产生的废水；
中心血站：检测实验室、中心实验室、质控室等实验室所产生的废水；
产品质检：食品分析室等实验室所产生的废水；
环境监测：水分析室、痕量分析室等实验室所产生的废水；
农业技术中心：化学室、药物残留室等实验室所产生的废水；
医院中心：理化室、检验室等实验室所产生的废水；
检验检疫局：保健中心、技术中心等实验室所产生的废水；
生物制药：理化分析、质检室、实验室等所产生的废水；
油田石化：采油厂、炼油厂、环境监测站等中心化验室所产生的废水；
企业：中心实验室、质检室、化验室等实验室所产生的废水。