加盟店申请特许经营备案，根据《特许经营管理条例》的规定，从事特许经营的企业，要向商务部门备案特许经营管理体系。国务院《商业特许经营管理条例》第七条第二款规定：「特许人从事商业特许经营活动应当拥有2个直营店，并且经营时间超过1年。」这就是我们俗称的「两店一年」，那么对于两店一年，该如何认定呢?
首先是两店，所谓的两店是指特许人拥有两家直营店。这里的直营店一般指以下主体：
1、特许人的全资子公司。
2、特许人持股超过51%的子公司。
3、特许人的分公司。
4、特许人的母公司，这里的母公司是指持有特许人的股份超过51%。
5、持有特许人51%股权的自然人股东及其配偶所开办的个体工商户。
6、店中店。这里的店中店是指特许人与卖场存在租赁合同关系，且该租赁关系一直在延续，所租赁关系所对应的是特许人的经营范围内的业务。
7、外国公司(含港澳台)委托投资的直营店。
其次是一年，这里的一年是指上述主体从事特许经营的业务时间超过一年。作为特许人需要提供一年的直营店银行流水，以此证明直营店具备盈利能力。
如果不具备特许经营资质而从事特许经营活动的，由商务部门进行处罚，根据《特许经营管理条例》第二十四条规定特许人不具备本条例第七条第二款规定的条件，从事特许经营活动的，由商务主管部门责令改正，没收违法所得，处10万元以上50万元以下的罚款，并予以公告。由此可见，在从事特许经营业务的伙伴，要抓紧时间进行特许经营备案。
