申请上海进出口权的流程：
一、到公司注册所在地区县工商局办理经营范围的增项手续【营业执照经营范围里没有进出口字样的企业必须办理，否则将影响后期的进出口业务与手续】；
二、到公司注册所在区县税务局办理经营范围的变更手续；
三、到上海市商务局办理对外贸易经营者备案登记手续，5个工作日后领取《对外贸易经营者备案登记表》；
四、到公司注册地所属区县管辖海关办理海关报关注册登记手续，同时到上海市市公安局指定的地点申刻报关专用章，申领海关注册登记证书，取得十位企业海关编码；
五、到上海市出入境检验检疫局办理自理报检注册备案登记手续；
六、向上海市海关中国电子口岸申请备案，取得入网许可并预约IC卡；
七、具有一般纳税人资格的出口企业办理出口退税登记.
什么是上海自营进出口经营权？
据上海备案资讯网了解，自营进出口权是指国家相关部委授予生产性企业经营本企业自产产品的出口业务和本企业所需的机械设备、零配件、原辅材料的进口业务，但国家限定公司经营或禁止进出口的商品及技术除外。
（一）申报生产企业（企业集团）自营进出口权，需提供下列材料一式十份，分送市经委六份，市外经贸委四份：
1、企业申请报告（内容包括：企业基本情况，产品出口情况，国际市场，自营条件，效益分析及发展目标）；
2、企业主管部门审核意见；
3、企业集团成立批文及集团成员企业产品出口情况（适用企业集团申报）；
4、企业法人营业执照复印件（需原注册登记机关签章）；
5、申请企业概况表；
6、企业出口产品分类表；
7、企业进出口商品目录；
8、企业前一年负债表和损益表；
9、企业前二年出口供贷实绩。
（二）申报商业、物资企业进出口经营权，除申报以上材料外，还需增报：
1、企业经营进出口业务的可行性报告；
2、企业前二年经营情况和进出口实绩证明；
3、资信证明。
上海进出口经营权备案办理流程如下：
1、网上提交企业基本情况，登陆系统后选择“备案登记”，出现备案登记机关选择“上海市外经贸局”，于空白登记表输入企业相关内容（“住所”为营业执照上的住所；“经营场所”为企业办公地点），点击“提交备案登记”成功后正反面打印并由企业法人签字、盖公章；
2、材料一式两份，一份先送去外经贸局存档，另一份再送市外经贸局备案；
3、企业材料提交合格后5个工作日到市外经贸局领取《登记表》，并由企业法人或负责人在背面签字、盖公章；
4、备案办理情况可以通过第三项“经营者查询”查询，输入企业名称和进出口企业代码（2012＋组织机构代码），如果正常显示即备案成功；
5、企业凭《登记表》在30个工作日内到海关、外汇、检验检疫、税务等部门办理有关登记手续，逾期未办理的《登记表》自动失效，须重新办理备案手续。