手术软器械也属于医院医用织物的范畴以内，按照相关规定以及实际运行，手术软器械的洗涤消毒流程也需要严格遵循WST/508-2016医院医用物洗涤消毒技术规范中感染织物的处理要求进行处理。
在手术过程中软器械（手术衣，手术铺单等）不可避免会被患者血液，体液，分泌物排泄物等污染，因此大部分的软器械处理过程中需要参照感染性织物要求处理，同时虽然在常规手术治疗之前的术前八项检查已经将常规的传染病病例进行了大比例的筛查，潜在的生物污染风险已经通过筛查降低了，但是术前八项之外未检查的项目也存在着一定的风险，因此需要严格按照消毒供应中心WS310.2-2016医院消毒供应中心第2部分清洗消毒及灭菌操作技术规范中关于分类回收的要求进行操作。
相对于传统医院纺织品的洗涤，可重复使用软器械由手术室器械护士进行分类以及前端处理之后，由密闭容器包装后送往消毒供应中心处理，在物流以及清洗消毒流程中也增加了独立封闭包装的工作量以及成本，基于医院信息化建设中对医院物资管理，手术信息管理，医院感染管理，手术室洁净度管理的要求，可重复软器械以及软器械的可重复使用处理流程要和医院的信息化系统进行互联互通。
作为医用织物的一种，洗涤周期上仍然需要严格遵守医用织物的洗涤周期以及消毒过程，由于软器械的组成面料密度低于纯棉面料，不吸水，结构紧密不透气的特性建议装载重量要低于传统的90%的装载重量，根据具体的面料密度来确定。
软器械主要采用的是聚酯化纤长丝+复合碳纤维+特氟龙涂层，聚酯纤维长丝的结构以及防水涂层使得纺织品不容易被水浸透，同时脏污成分也不易侵入纺织品内部组织结构中，只需要根据软器械使用环境中的脏污成分针对性的进行溶解处理（以人体组织液，血液分泌物等成分为主），相对于传统医院织物洗涤中处理脏污成分的多样化，脏污渗透程度来说软器械的脏污成分附着强度较低，但是温度的控制也重要的多，必须确保预洗温度严格控制在40度以下；由于主要的清洗工作在预洗阶段完成，建议可以将预洗工作时间相对延长，增加过水次数；同时由于软器械阻水的特性，在预洗阶段需要确保完整的浸泡以及洗涤剂的有效接触，在预洗阶段设备的要求，以及注水方式应该区别于传统的设备需求。