税务尽职调查一般由涉税中介机构在企业的配合下进行，对目标企业所在行业、历史沿革、人力资源、营销与销售、研究与开发、生产与服务、采购、法律与监管、税务与会计、管理信息系统等与税务有关的全部信息作全面深入的审核。
实际上，在我国绝大多数的投资、并购、重组等业务中，税务尽职调查并没有受到足够的重视，往往由法律尽职调查或财务尽职调查一带而过。但事实上，税务尽职调查与法律尽职调查、财务尽职调查同等重要，税务上的考量甚至于可能成为造成交易能否达成的关键因素。
税务尽职调查的常见方法
◆比对法：比对目标公司提供的财税资料（如：管理层财务报表、审计报告、税务申报表、相关商务数据），识别不同文档中的数据及信息差异，为异常数据归因作基础准备。
◆验算法：根据目标公司提供的财务数据，按税法规定确定其计税基础，验算应纳税额，核对其与目标公司纳税申报表上的数据是否一致。
◆访谈核实法：与目标公司业务人员访谈，全面深入了解目标公司的业务模式。业务人员不是财税人员，他们披露的涉税信息有利于税务核查者循迹发现税务风险。基于此，再与目标公司财税人员进一步讨论确认。
◆异常数据归因：基于上述方法取得的工作成果，对异常数据进行分析，归集无法合理解释的事项，进一步确定税务风险。
税务尽职调查的目的是判明潜在的致命税务缺陷和它们对收购及预期投资收益可能的影响，致命的税务缺陷是指目标企业所面临的如果不解决或不恰当地修正就会对企业造成相当程度损害的、突出的税务风险。
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