复合土工膜铺设时由坡肩自上而下滚铺至坡脚，中间不应有纵向连接缝。渠坡和渠底结合部以及和下段待铺的复合土工膜部位要预留足够的搭接长度，一般控制在50～80cm，坡肩处预留复合土工膜的长度应满足设计要求。铺设过程中可用编织袋装土覆压，随铺随压，以防止复合土工膜滑移。使复合土工膜幅宽与渠道中心线垂直。渠底复合土工膜间横向连接缝与坡面复合土工膜接头缝均应相互错开100cm以上。铺设齿槽部位的复合土工膜时，应松弛适度，且与齿槽贴紧，铺设完毕后及时用临时支撑固定保温板和土工膜。支撑约2m左右一个，待混凝土浇筑满槽后取出，清理干净待用。复合土工膜裁剪应整齐平顺，并保证足够的搭接宽度。遇到建筑物墩柱时根据建筑物尺寸在复合土工膜上进行标识，根据标识线进行裁剪，标识尺寸应考虑与建筑物的粘结宽度。
复合土工膜与墩、柱、墙等建筑物须进行粘接，粘接宽度不小于设计要求，建筑物周围复合土工膜应充分松弛。为保证土工膜与建筑物粘结牢固，防水密封可靠，在对土工膜或墩柱进行涂胶之前，应将涂胶基面清理干净，保持干燥。涂胶均匀布满粘结面，无过厚、漏涂现象。在粘结过程和粘结后2h内，粘结面不得承受任何拉力，严禁粘结面发生错动。
缝合底层土工布、热熔焊接或粘接中层土工膜、缝合上层土工布。
土工膜接缝热熔焊接一般采用热合爬行机焊接。施工时应根据天气情况适时调整。环境气温在5～35℃之间，焊接土工膜比较适宜。在气温低于5℃时，为保证焊接质量，必须对搭接面进行加热处理。当环境温度和不利的天气条件严重影响土工膜焊接时，应停止作业。土工膜焊接前应将土工膜焊接面上的尘土、泥土、油污等杂物清理干净，水汽用吹风机吹干，保持焊接面清洁干燥。多块土工膜连接时，接头缝应相互错开100cm以上，焊接形成的结点应为“T”字型，不得为“十”字型。。为确保土工膜的焊接头具有可靠的防渗效果，通常采用双焊缝焊接。双焊缝宽度宜采用2×10mm，搭接宽度不小于10cm，焊缝间应留有约1cm的空腔。应防止发生漏焊、烫伤和褶皱等缺陷。在焊接过程中和焊接后2h内，焊接面不得承受任何拉力，严禁焊接面发生错动。当施工中焊缝出现脱空、收缩起皱及扭曲鼓包等现象时，应将其裁剪剔除后重新进行焊接。出现虚焊、漏焊时，用特制焊枪补焊。焊机应定期保养和维护，及时清理杂物。
土工布缝合，将上层土工布和中层土工膜向两侧翻叠，将底层土工布铺平、搭接、对齐，进行缝合。土工布缝合采用手提缝包机，缝合时针距控制在6mm左右，连接面应松紧适度、自然平顺，土工膜与土工布联合受力。上层土工布缝合方法与下层土工布缝合方法相同，土工布缝合强度应不低于母材的70%。