方舱医院用的污水处理设备-医疗废水处理一般分为一级处理消毒、二级处理消毒，方舱医院废水排放必须消毒处理后再纳入市政管网排放及排河。对于传染病医院建议采用二级处理高层度处理消毒处理。
方舱医院用的污水处理设备废水处理主要是消毒，即杀灭病原体。方舱医院废水的水质十分复杂，一般随着用水量的加大，相应的污染物浓度也越来越高，医院废水处理流程应尽可能设调节池，调节池不但可以调节水量，消灭高峰负荷，并可以调节水质，使其处理效果不会因水质变化而受到干扰二氧化氯消毒剂的投加点一般选择在调节池之后。浮选沉淀后经消毒池（由二氧化氯混合发生器制备的消毒剂）进行消毒后，达标排放。自发浮选沉淀池的剩余污泥排入调节池，调节池和接触氧化池的污泥打入消化池进行好氧消化处理可达标排放。
方舱医院医院、工厂、乡镇、社区污水处理与消毒后，应达到下列标准:一、连续三次各取样进行检验，不得检出XG病毒以及其他如肠道致病菌和结核杆菌等致病菌。
方舱医院用的污水处理设备对医院污水产生、处理、排放的全过程进行控制。减量化原则。严格医院内部卫生安全管理体系，在污水和污物发生源处进行严格控制和分离，医院内生活污水与病区污水分别收集，控制、清污分流。严禁将医院的污水和污物随意弃置排入下水道。就地处理原则。为防止医院污水输送过程中的污染与危害，在医院必须就地处理 分类指导原则。
根据医院性质、规模、污水排放去向和地区差异对医院污水处理进行分类指导。达标与风险控制相结合原则。考虑综合性医院和传染病医院污水达标排放的基本要求，从工艺技术、工程建设和管理等方面提高应对突发性事件的能力。