蛋白质分子质量或称蛋白质相对分子质量，是指蛋白质所含的各原子的相对分子质量之和，是蛋白质的重要理化参数，也是蛋白质鉴定必不可少的内容。如果想知道蛋白的分子质量，就要对其进行测定，那么测定蛋白质的分子质量的方法有哪些呢？
随着生命科学的发展进步，衍生了很多蛋白质分子量的测定方法，如化学法、渗透压法、凝胶色谱法、聚丙烯凝胶电泳法、沉降法、光散射法以及质谱法等，其中凝胶渗透色谱法（GPC）和基于质谱的方法是鉴定蛋白质分子质量Z_U_I常用的方法。
凝胶渗透色谱主要利用凝胶色谱柱将大小、体积不同的蛋白质分子进行分离，并依次进入浓度检测器进行分析，可得到蛋白体积（Ve）与蛋白浓度的凝胶色谱图，再借助GPC校正曲线可以将Ve转换成相对分子质量M，从而实现蛋白混合物中各组分的相对分子质量鉴定。
质谱法主要利用电喷雾离子化质谱（ESI）和基质辅助激光解吸电离质谱（MALDI）进行蛋白分子量分析。质谱法相比其他方法存在明显的优势，只需要少量的蛋白样品即可检测，且检测结果分辨率和准确性更高，能测量的分子量范围更广，因此更适合复杂蛋白混合物的相对分子质量分析。
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