蛋白定量与磷酸化组就是将磷酸化蛋白质进行定量分析，即磷酸化定量蛋白组分析，用于检测某一磷酸化蛋白的含量水平。
磷酸化定量蛋白组分析的大致流程如下：首先将含磷酸化修饰的蛋白样品进行酶切；然后利用TiO2、抗体或IMAC技术富集磷酸化肽段；将富集得到的磷酸化肽段进行串联质谱分析；zuì后利用质谱数据结合生物信息学分析对磷酸化蛋白质的含量进行鉴定。
在进行磷酸化蛋白定量分析时，由于很多样品是磷酸化和非磷酸化蛋白的混合物，磷酸化肽段丰度较低，因此对磷酸化蛋白质或肽段的富集是有效鉴定的关键一步，直接影响着鉴定结果的准确性。
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