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申请双软认定，一方面，软件产品的增值税可以由17%减免至3%，软件企业认定的优惠是：2011年1月1日后依法在中国境内成立并经认定取得软件企业资质的法人企业；经认定后，在2017年12月31日前自获利年度起计算优惠期，第一年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按照25%的法定税率减半征收企业所得税，并享受至期满为止。经认定的软件生产企业的工资和培训费用，可按实际发生额在计算应纳税所得额时扣除。 泉州双软认证，厦门双软认证，漳州双软认证
申请国家高新技术企业，主要是企业所得税由25%减免至15%，研发费用可以加计扣除。
以上是优惠政策的区别，想申请双软，必须是从事软件销售和系统服务为主的企业性质，而这类企业如果拥有一定数量的知识产权，年均增长率又能达到35%以上等多种条件，则也可以申请国家高新技术企业。
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