1、利用微生物防治。常见的有应用真菌、细菌、病毒和能分泌抗生物质的抗生菌，如应用白僵菌防治马尾松毛虫（真菌），苏云金杆菌各种变种制剂防治多种林业害虫（细菌），病毒粗提液防治蜀柏毒蛾、松毛虫、泡桐大袋蛾等（病毒），5406防治苗木立枯病（放线菌）微孢子虫防治舞毒蛾等的幼虫（原生动物），泰山 1号防治天牛（线虫）。
2、利用寄生性天敌防治。主要有寄生蜂和寄生蝇，常见有赤眼蜂、寄生蝇防治松毛虫等多种害虫，肿腿蜂防治天牛，花角蚜小蜂防治松突圆蚧。
3、利用捕食性天敌防治。这类天敌很多，主要为食虫、食鼠的脊椎动物和捕食性节肢动物两大类。鸟类有山雀、灰喜雀、等捕食害虫的不同虫态。鼠类天敌如黄、猫头鹰、蛇等，节肢动物中捕食性天敌有瓢虫、螳螂、蚂蚁等昆虫外，还有蜘蛛和螨类。 利用生态系统中各种生物之间相互依存、相互制约的生态学现象和某些生物学特性，以防治危害农业、仓储、建筑物和人群健康的生物的措施。
根据其危害可以大致分为以下几类:
1、可以传播疾病的有害生物。
2、由境外传入的非本地(或一定自然区域内)的原有生物， 可能对我国生态环境造成破坏的动物、植物、微生物及病毒等，如红火蚁、松材线虫、豚草、水葫芦等。