医疗器械经营登记证和医疗器械经营许可证的处理条件不同:国家药品监督管理局要求，申请第三类医疗器械经营许可证的企业必须使用符合医疗器械经营质量管理标准的GSP软件；对于申请第二类医疗器械经营备案证的企业，国家药品监督管理局建议使用GSP软件，但不是强制性要求。从提交的信息来看，申请第三类医疗器械经营许可证提交的信息需要包括计算机信息管理系统的基本信息介绍和功能描述，而不需要获得第二类医疗器械经营备案凭证提交的信息。
我司代办第三类医疗器械经营许可证的：1、全面服务 提供集咨询+策划+申请一站式服务，为代办第三类医疗器械许可证企业提供从第三类医疗器械许可证申请到第三类医疗器械许可拿证等期间一系列会遇到的咨询闭环服务。2、从事企业服务十余年，从政策分析、文案撰写、审批流程各个环节为客户提供的代办第三类医疗器械经营许可证申请服务。3、人脉资源 沉淀了十年的政企协作经验，积累出深厚的政企人脉资源，为代办第三类医疗器械经营许可证的客户解决疑难、复杂等 问题。4、团队协作 从咨询→了解客户需求→策划解决方案→签订合同→售后跟进。
一般来说，技术代办公司组织不仅有技术精英团队，也有很多年积累出来的人脉关系。假如要想快又准地把许可证代办，寻找代办公司组织的协助是不可或缺的。并且更关键的一点便是，寻找代办公司组织协助的情况下，干万不可以嫌不便。或是贪便宜，不然很容易得不偿失。
这里有一个问题，那就是如果公司不涉及到储存或者全部的储存交由其它的医疗器械经营企业进行储存的话，可以不设立库房。库房的面积是有要求的，一般南昌市医疗器械公司申请条件要求库房的场地面积不能够低于四十平方米。除了库房面积有要求之外，库房还需要建立一套类似于进销存的系统，能够很好地跟踪每一个批次的医疗器械的去向。在南昌市医疗器械公司注册的时候，质监部门的检查人员会考核员工对于系统的熟悉程度。现在这套系统有很多几个厂商能够提供，申请材料里面还需要提供这个系统的功能等相关说明。
办理江西南昌三类医疗器械经营许可证需要的资料：1、《医疗器械经营企业许可证申请表》。2、工商行政管理部门出具的《企业名称预先核准通知书》或《工商营业执照》。3、申请报告。4、经营场地、仓库场所的证明文件，包括房产证明或租赁协议和出租方的房产证明的复印件。5、经营场所、仓库布局平面图。
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有下列经营行为之一的，企业可以不单独设立医疗器械库房：（一）全部委托为其他医疗器械生产经营企业提供贮存、配送服务的医疗器械经营企业进行存储的，（二）专营医疗器械软件或者医用磁共振、医用X射线、医用高能射线、医用核素设备等大型医用设备的；（三）省级食品药品监督管理部门规定的其他可以不单独设立医疗器械库房的情形。
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申请医疗器械备案凭证的具体程序:
1、到工商行政管理部门办理营业执照，注册为企业，个体工商户不得办理备案凭证。
2.到质监局办理组织机构代码证。
3.在国家食品药品监督管理局网站上使用组织机构代码注册账户，在线申报。
4.在线提交《医疗器械备案申请表》所需的电子资料。
办理三种医疗器械经营许可证的程序如下：
1.准备必要的处理资料:
(1)《医疗器械经营许可证申请表》；
(2)资格证书；
(3)营业执照或企业名称预先核准证书复印件；
(4)质量管理人员证书；
(5)售后服务人员资格证书。
2.需要办理许可证的企业经营者携带上述材料到当地市级人民政府食品监督管理部门申请营业执照；
3.管理部门受理资料，30个工作日内审核，必要时组织审核；
4.符合条件的，管理部门发行医疗器械经验许可证，不符合条件的，管理部门不予许可，书面说明理由。