认真履行审批职能，全面规范证书核发
各办事处要认真履行审批职能，从严从实从细抓好审核工作，确保证书核发合法、规范、严谨。
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一、定义上的区别
1、转厂的定义：深加工结转（转厂）指的是在中国内地由合资企业或者外资加工企业生产加工的出口用产品，转向另一个在内地的合资企业或者外资加工企业进行组装、加工。从商品流通来看，‘转厂’在国内进行，属于国内交易。但是，因为生产加工的产品是出口产品，而且交易双方大多是外资或者合资企业,结算都是在境外用外汇进行，所以‘转厂’被视为是加工贸易的一环。
2、保税区转厂：国内的一般贸易的企业（包括有进出口权或没有进出口权的）如果希望把产品转厂给加工贸易企业（来料加工或进料加工企业），那么你就需要用到——保税区转厂。
二、流程的区别
1、 深加工结转流程：
备案（ 电子申请表备案/ 纸质申请表备案）——→报关 ——→ 付 款
2、 保税区转厂的流程：
1）国内没有进出口权的企业通过买单出口到保税区(兜圈退税)/物流园（进园税），然后国内的加工贸易型企业利用手册（清关/转关）进口；
2）国内一般贸易企业一般贸易出口到保税区(兜圈退税)/物流园（进园税），然后国内的加工贸易型企业利用手册（清关/转关）进口；
3）国内加工贸易企业手册出口核销到保税区(兜圈退税)/物流园（进园税），然后国内的加工贸易型企业利用手册（清关/转关）进口；
三、加工贸易型企业利用保税区转厂的好处
1、 加工贸易企业利用保税区转厂可以达到退税目的（如果做直接转厂，企业不能够向税务局申请出口退税）
2、 可以解决报关资料不附（双方商品编码不相同）的问题；
3、 效率快：进出福保以及手续办理只需半天的时间。
一是严格审查境外证书，通过查验证书正本、扫描证书二维码、登录境外管理机构网站查询等多种方式对外方证书的合法性、有效性进行审查，对确有异议或者公约要求必须开展对外确认的，应及时报送我办向外方核实。二是从严审核进口公约附录Ⅱ树木物种的申请，原则上应当在核发进口许可证前审验并留存境外证书正本，因特殊原因确实无法提交的，应当在许可后及时收回留存，不接受未经出口国海关在签注栏内签注数量并签字盖章的境外证书。三是谨慎开展出口审批，对出口社会关注度高、尚未规模化种植的公约附录物种的申请或其他出口可能影响该物种生存的申请，应及时向国家濒危物种科学委员会咨询，得到同意出口回复后方可核发允许出口证明书。四是严抓证书核发质量关，熟练掌握各类野生植物允许进出口证明书的使用范围及其所应包含的内容，准确、规范描述物种名称、来源、保护级别、贸易目的、标本类型和数量单位等要素信息。五是严格证书延期、变更审批，准确把握延期申请的时间节点、延长期限以及变更申请的具体内容，不可随意对证书进行延期和变更。