高新技术企业审计报告是企业办理国家高新过程中必须的材料之一，需要企业提供近三年的财务审计，专项审计以及近一年的高新技术产品收入审计。比如企业要申办2019年国家高新，则需要企业提供2016年，2017年，2018年(近三年)的审计报告。
其中的专项审计报告是由科创委等相关认定部门指定具有相关资质的会计师事务所才可以办理。
根据高新技术企业认定专项审计指引指出有关财务指标需要企业出具专项审计报告，请提供审计期内(近三年)以下资料。
国家高新技术企业专项审计报告材料清单：
1、 近三年度企业所得税汇算清缴申报表或审计报告(全套完整报表)
2、 近三年加计扣除资料税务机关备案资料、专项审计报告(无则不用提供)
3、 财务情况说明书
4、 研发费相关资料，如：
(1)各年管理费用研发费用明细账(单独核算，财务系统导出);
(2)各年研发设备折旧清单(含名称、型号、原值、采购时间、月折旧、本年累计折旧等信息)，应与每年研发费中的折旧费核对相符。
(3)每年1月、3月、6月、9月、12月工资计提及发放单。
(4)每年技术开发费发票及合同。
5、 各年高新技术产品收入明细表(分年按不同产品类别列表，内容包括：发生时间、凭证号、内容、金额等)、重要销售发票复印件、收入有关合同复印件.
6、 知识产权证书复印件
7、 研发项目立项证明(科技部门立项文件或自行立项报告，自行立项的需有主管人员审批签字)、项目完成情况明细表
8、 研究开发活动说明材料——项目研究开发的效用情况说明、研究成果报告等资料
9、 建立研发投入核算制度、产学研合作证明、研发机构证明(省市区研发中心确认文件或组织机构图)、研发设备清单、研发人员的绩效考核奖励制度。
10、研发人员名册(内容包括：姓名、学历、砖业、职称)，缴纳社保情况证明，近三年12月研发人员工资单等。