UPS电源，特别是智能化的UPS电源，本身含有大量的集成电路。而且越来越多的UPS带有智能管理系统，信号线也成为雷电电磁脉冲侵入的通道。正因为此，关于UPS电源遭受雷电侵害的案例屡见不鲜， 特别是在雷暴日比较多的雷击区。
PC UPS电源的雷电防直击雷、感应雷和雷电电磁脉冲等都有可能对UPS电源造成损害， 因+此要做好UPS的防雷就必须严格遵守《建筑物电子信息系统防雷技术规范》综合防雷系统的要求，做好以下几点：
要将外部防雷措施和内部防雷措施统筹兼顾，全面规划， 切实做好接地和等电位连接。完善设备所在建筑物外部防雷系统，按照国标《建筑物防雷设计规范》（GB50057-94（2000年版）），安装接闪器， 引下线以及防雷接地网等设施。做好机房接地，根据国标《电子计算机房设计规范》（GB），交流工作地、直流工作地、安全保护地、 防雷接地宜共用一组接地装置，其接地电阻按其中最小值要求确定；如果必须分设接地，则必须于两地之间加装等电位共地联结器。
要采取多级防护措施。所谓多级防护就是按照电磁兼容的原理分层次地对雷电流进行削弱，在动力线进户配电柜、楼层配电柜以及机房进户配电盒，安装适配的避雷器。对于有信号或通信接口的UPS， 为防止雷电波从信号或通信线引入，必须在信号或通信线接口处加装相应的信号避雷器。雷电防护的中心内容是泄放和均衡，泄放将雷电流尽可能多的、 尽可能远的是泄放于地，而拒之于通信系统之外。均衡是减小雷电流在诸导电物体上产生的电位差，防止雷电流的反击。
UPS电源的安装位置要讲究。依据国际电工委员会ICE1312一1((雷电电磁脉冲的防护》的建筑物分区方法， UPS电源机房属LPZ1区，在本区内的物体不可能遭受直接雷击，在本区内的电磁场有可能衰减。 就是UPS电源应安装在LPZ1区内，同时，为防范雷电流产生的强电磁场干扰，UPS电源放置离墙应有一定的距离，与外墙立柱钢筋引下线的距离≥0.83m， 即设备处在雷电流磁场的安全区内。并把机器外壳屏蔽接地，机柜门用导线与地加强连接，机柜内成为LPZ2区。