随着柴油发电机组智能化的不断提高，柴油发电机组控制系统不仅仅满足于运行时自主监测、遇到故障自动报警停机、市电故障自动启动并切换运行等等。
至今可发展为远程操作、监控柴油发电机组运行数据并可以进行远程检测维修故障，只要有网络，就可以采用手机或PC电脑远程监测柴油发电机组的运行数据，控制柴油发电机组的运行。
柴油发电机组在运行使用中也有一定的环境要求与运行参数要求的，一旦柴油发电机组的使用环境要求与其技术要求不一致，则表现为功率不足或者运行不正常。如果运行中有些参数超过某些指标则柴油发电机组保护系统因自动保护而停止运行，柴油发电机组使用过程中会经常出现突发性严重损害。
柴油发电机组加装保护装置是很有必要的，当柴油发电机组油管爆裂，缺少机油时，油压保护系统将开始工作，立即将机组停止工作。当柴油发电机组供油系统出现故障，柴油发电机组产生超速保护系统开始工作，立即拉动断油器，使柴油发电机组停机。当油温和水温超过极限温度时，温度系统将开始工作，使柴油发电机组停止工作。