检测技术服务:百泰派克生物科技BTP客户案例：利用蛋白质谱鉴定对多粘类芽孢杆菌KF-1分泌的半纤维素降解酶进行分析鉴定--检测技术服务详情
关键词：百泰派克生物科技,蛋白质质谱鉴定,质谱鉴定蛋白,百泰派克生物科技,生物药物表征,生物药物多组学,优质服务商,蛋白质组学,代谢组学,tmt,抗体测序,itraq,蛋白质谱鉴定
期刊：Catalysts；影响因子: 4.6407
原文链接：DOI: doi.org/10.3390/catal8120589
研究对象：多粘类芽孢杆菌
研究目的：多粘类芽孢杆菌中的半纤维素降解酶研究
研究手段：蛋白质谱鉴定等
研究内容及结论：多粘类芽孢杆菌具有显著的半纤维素降解活性。该研究通过LC-MS/MS分析，从多粘芽孢杆菌P. polymyxa KF-1分泌的蛋白质组中鉴定出13种半纤维素降解酶。根据活性测定，P. polymyxa表现出木聚糖内切酶、β-甘露糖苷酶、β-木糖苷酶，α-半乳糖苷酶和α-L-Af活性，其中α-L-Af活性zuì高。从酶提取物中鉴定出四种预测为Af的蛋白，其中2个归类于GH43，另外2个归类于GH51 α-N-阿拉伯呋喃糖苷酶。该研究克隆和表达了一个新的属于GH51的α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶，PpAbf51b。重组PpAbf51b在大肠杆菌BL21（DE3）中被生产出，凝胶过滤层析发现其为四聚体。实验发现，PpAbf51b在pH值6.5和40℃时zuì活跃，但在较宽的pH范围内（pH 4.0-11.0）均表现稳定。PpAbf51b特异水解含有中性阿拉伯糖的多糖，包括甜菜阿拉伯聚糖、linear-1,5-L-阿拉伯聚糖、小麦阿拉伯木聚糖，主要产物为L-阿拉伯糖。水解产物表明，PpAbf51b具有exo-α-L-阿拉伯
呋喃糖苷酶的功能。此外，研究还发现PpAbf51b与长枝木霉（Trichoderma longibrachiatum）endo-1,4-木聚糖酶结合，对小麦阿拉伯木聚糖的降解具有显著的协同作用。综上，本研究从多粘类芽孢杆菌KF-1的分泌物中鉴定出一种新的α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶，且该酶具有应用于生物技术产业的潜力。
利用LC-MS/MS技术对P. polymyxa KF-1分泌的半纤维素降解酶进行分析鉴定，该服务由北京百泰派克生物科技提供。分泌蛋白组学分析鉴定出13个蛋白质属于半纤维素降解酶，4个木聚糖酶属于GH10和GH11家族，4个GH43酶，2个GH51家族的具有α-L-AF_C超家族结构域的α-N-阿拉伯呋喃糖苷酶，1个GH27α-半乳糖苷酶和1个GH44 β-甘露糖苷酶。为后续克隆和鉴定PpAbf51b提供了基础。
参考文献：Hu Y, Zhao Y, Tian S, et al. Screening of a novel glycoside hydrolase family 51 α-L-arabinofuranosidase from Paenibacillus polymyxa KF-1: cloning, expression, and characterization[J]. Catalysts, 2018, 8(12): 589.
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