申请高新企业门槛还是比较高的，很多企业在高新申报时，还是经常被国家相关部门否定，认证通不过。这其中的原因，主要有以下几个方面：
一是领域不符合，企业所属行业属传统及淘汰行业；
二是企业缺乏核心自主知识产权；
三是研发项目缺乏科学的设计和安排；
四是研发费用未按认定办法的要求归集，且比例难以达到认定要求；
第五是高新产品或服务收入比例较低；
第六是缺乏严格规范的研发体系和相应的组织管理安排等
申请条件
（一）企业申请认定时须注册成立一年以上；
（二）企业通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权；
（三）对企业主要产品（服务）发挥核心支持作用的技术属于《国家重点支持的高新技术领域》规定的范围；
（四）企业从事研发和相关技术创新活动的科技人员占企业当年职工总数的比例不低于10%；
（五）企业近三个会计年度（实际经营期不满三年的按实际经营时间计算，下同）的研究开发费用总额占同期销售收入总额的比例符合如下要求：
1. 最近一年销售收入小于5,000万元（含）的企业，比例不低于5%；
2. 最近一年销售收入在5,000万元至2亿元（含）的企业，比例不低于4%；
3. 最近一年销售收入在2亿元以上的企业，比例不低于3%。
其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%；
（六）近一年高新技术产品（服务）收入占企业同期总收入的比例不低于60%；
（七）企业创新能力评价应达到相应要求；
（八）企业申请认定前一年内未发生重大安全、重大质量事故或严重环境违法行为。