三类进口医疗器械射频治疗仪的代办注册费用会受到多个因素的影响，包括产品的性质和复杂性、所在国家或地区的法规要求、代办注册公司的收费政策以及其他相关因素。因此，具体的注册费用可能会有很大的变化。
一般而言，代办注册费用可能会包括以下方面的费用：
申请费：这是向监管机构提交注册申请所需的费用。
文件准备费：费用可能包括准备和审核技术文件、质量管理体系文件和其他相关文件的成本。
审核和检查费：如果监管机构要求对生产设施进行审核和检查，费用可能会增加。
法规合规性咨询费：如果您需要法规专家或律师的咨询服务来确保合规性，这些费用也需要纳入考虑。
代办注册公司的服务费：代办注册公司通常会收取一定的服务费用，以协助您完成代办注册过程。
其他费用：可能还包括翻译、旅行、办公室租赁等其他与注册相关的费用。
由于上述因素的不同组合，代办注册费用可能会在数千美元到数万美元之间变化。建议您与多家代办注册公司联系，向他们咨询具体的注册费用和费用结构，以便选择适合您的需求和预算的代办公司。确保与代办公司讨论清楚他们提供的服务范围，以确保您的注册过程是符合法规的。请注意，确保产品的合规性和安全性是重要的，不要因费用而牺牲质量和合规性。