二级医疗器械LED光子治疗仪产品的许可证办理过程一般包括以下步骤：
1. 准备阶段：技术文件准备： 收集LED光子治疗仪的技术资料，包括技术文件、产品说明、制造工艺、质量控制、临床试验等。
质量管理体系： 确保具备完善的质量管理体系，符合医疗器械相关法规要求。
2. 申请阶段：填写申请表格： 根据监管机构的要求填写并提交医疗器械注册申请表格，并附上所需的技术文件。
申请递交： 将填写完整的申请表格和所需文件递交给相关的监管机构，通常是国家药品监督管理局或类似机构。
3. 审核和评估阶段：技术审核： 监管机构会对申请文件进行审核，包括对技术文件、质量管理体系、临床试验数据等的评估。
现场审查（可能需要）： 可能需要进行现场审查，以确认生产设备、生产流程和质量管理等符合要求。
4. 批准和颁证阶段：审批和颁证： 在审核通过后，监管机构颁发医疗器械注册证书，确认LED光子治疗仪符合销售和使用的标准。
5. 持续合规维护：合规维护： 持续遵守相关的法规和标准，确保产品和生产过程的合规性。这可能涉及定期的检查和质量管理体系的维护。
请注意，不同国家和地区的医疗器械注册流程和具体要求可能有所不同。因此好在申请之前详细了解当地监管机构的规定和要求，并在申请过程中遵循其指导。有时候，这个过程可能会比较复杂，建议寻求的法律和合规咨询来确保顺利完成注册流程。