商务车指标分为两类：一类是香港经大桥进入内地，并领取内地车牌的指标；第二类是内地经大桥进入香港，并领取香港车牌的指标。指标有效期为5年，到期后按照届时规定条件延期，到期3年仍未办理延期的，指标将被注销，供其他符合条件的申请人使用。获得批准后，车辆在大桥通车后方可通行。
境外到我省投资企业（含港澳台地区和外国公司及境外投资者）
对到广东省投资的境外投资企业（个人），不论投资额多少，省内企业3年内（含申办当年）纳税额累计达到10万元人民币以上者就可以申办1辆通行港珠澳大桥口岸的商务车辆指标；纳税50万元人民币以上的，可申请第2辆；100万元人民币以上的可申办第3辆。以往申请过其他口岸车辆的，不受限制，仍可提出申请。