在含水层段的过滤器与井壁之间为水质和防止过滤器淤塞有时还要填人筛选的砾石以增大量并起过滤作用在非含水层段或计划封闭的不良含水层段填人粘土或水泥等止水物达到封闭和止水的目的以防井水被污染，在设计井身结构时应根据钻井的目的、用途、地层条件和有关规范进行并尽可能简化井身的结构，如果井身结构过于复杂使孔径扩大不仅减慢施工速度也会材料消耗造成不必要的浪费。反之如果井身结构过于简化了必须插人的套管虽然缩小了井的直径但可能造成井内钻进事故反而了成本而且重要的是会使层间止水效果差，地下水互相串通，造成对地下水污染的严重后果。
打水井注意事项， 农村水井中一般存在缺氧和透风不良的情况，加之受害人又使用了汽油机水泵，轻易造成等有毒有害气体在井中蕴蓄，很轻易发生中毒、窒息等事故。因此。提醒村民在下井前要向井内送风，钻水井下井时好要有人陪同。另外，一旦发现井下有人中毒，井上职员切不可贸然下井施救，好及时求救。如钻水井要下井施救，一定要做好自身的安全措施后再下井。如何选择打井的地点。般要打井的地方应该是城郊或小一些的城镇或农村由于这些地方的排污或排水设施不够健全容易污染水井有的郊外或村庄地区有农田或菜地现今的农作物都要施化肥和这些及化肥在土地中不容易分解会随水源渗入地下水中打水井所以打井要远离污染区如果周围有农田或菜地无法避免建议将井打深一些井的四周要作防渗处理比如用空心水泥柱体形成隔离等。